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尊龙凯时MGIEasy V30全基因组甲基化文库制备:助力高效甲基化研究!

发布时间:2025-01-31   信息来源:石苛冰

近期,尊龙凯时针对其DNBSEQ平台的甲基化建库与测序功能进行了全面升级,推出了新一代建库产品MGIEasy全基因组甲基化文库制备试剂盒V30(MGIEasyWholeGenomeMethylationSequencingLibraryPrepKitV30,以下简称WGMSV30)。该试剂盒采用双链加接头的方法,以物理打断获得的DNA片段为基础进行建库,并结合酶法转化技术,将非甲基化胞嘧啶(C)转化为尿嘧啶(U)。通过与DNBSEQ平台的结合,WGMSV30能够实现单碱基精度解析DNA甲基化状态,构建详细的全基因组甲基化图谱。

尊龙凯时MGIEasy V30全基因组甲基化文库制备:助力高效甲基化研究!

WGMSV30为大规模人群表观组研究、表观遗传学基础研究、动植物研究、疾病甲基化标志物筛选及药物研发等多个领域提供高效且精准的全基因组甲基化建库解决方案。目前,WGMSV30已与MGISEQ-2000平台成功适配,结合该平台的升级算法,在测序时无需添加平衡文库,实现了0平衡文库的纯甲基化文库测序。此外,尊龙凯时研发团队正在针对WGMSV30适配DNBSEQ-T7进行稳定性测试,更多实测数据也将在后续分享,敬请期待。

在实际应用中,使用三批不同WGMSV30构建NA12878标准品的DNA甲基化文库,不添加平衡文库,平行上机MGISEQ-2000ECR70(搭配SM测序试剂)和ECR71(搭配SM20测序试剂),PE150测序中,单lane reads产出稳定在约400M,单个文库可获得约120G的原始下机数据,轻松实现“1库1lane”,且测序质量良好,SM测序试剂Q30稳定在89%左右,SM20测序试剂Q30稳定在94%左右,Q40稳定在87%左右。

试剂盒采用转化损伤小的酶法,大幅增加文库插入片段长度,进一步支持PE150测序。不同批次的WGMSV30建库试剂盒构建的NA12878标准品DNA甲基化文库插入片段(主峰约280bp)表现出高度一致性。试剂盒还优化了末端修复反应的体系和步骤,显著降低了Reads末端M-bias碱基个数。SM20版测序试剂在搭配ECR71软件版本时显示,不同批次建库试剂盒构建的NA12878标准品DNA甲基化文库的M-bias表现也保持一致,BottomStrand和TopStrand的Read1及Read2甲基化率几乎完全重合。